シーズン3は、上院議員暗殺の濡れ衣を着せられたエリザベスが、黒幕の司法長官トム・コノリーを射殺して、レディントンと共に追われる身になっている状態で始まる。クリエーターのジョン・ボーケンキャンプが「パワーアップされたボニーとクライド」と呼ぶエリザベスとレディントンはFBIに追われているうえ、陰謀を暴こうとしていた「結社」からも追われるという切羽詰まった状況に置かれる。そんなシーズン3について、ボーケンキャンプは「シーズン1と2では、エリザベス・キーンが自分の過去や家族について疑問を持ち、その謎に迫ろうとするところを描いていたけれど、シーズン3では彼女にそんな暇はない。自分にまつわる秘密や記憶にこだわっている余裕など無しで、現在の状況を切り抜けていかなければならなくなる。これまでのシーズンが過去に目を向けていたのに対し、シーズン3は今、その瞬間の彼らにフォーカスが当てられている」と説明する。それゆえ、ボーケンキャンプが「アドレナリン全開の逃亡劇」と称するシーズン3は、これまでよりさらにスリリングな展開が期待できるシーズンになっている。

正義のために闘うFBI捜査官という仕事と、愛し愛される夫を持つという満ち足りた生活が、レディントンの出現によってもろくも崩れ去ってしまったエリザベス。さらに、母親がロシア人スパイだったという出自を利用されて陰謀に巻き込まれ、自己防衛のために殺人を犯すことになる。
FBI捜査官として“ブラックリスト”の犯罪者を追っていたエリザベスは一転、FBIの指名手配犯となり、レディントンが持つ人脈や秘密工作といった闇の世界に足を踏み入れることになるのだ。FBIのみならず、二人を亡き者にしようとする陰謀組織「結社」の追跡をかわすためには、“ブラックリスト”の犯罪者たちをも利用せざるをえない。犯罪者の手を借りてまで逃亡しなければならないのか。FBIの指名手配犯となり、かつての同僚に追われる身となってレディントンの生きるダーク・ワールドに足を踏み入れるという、これまでの生き方から180度の転換を迫られて苦悩するエリザベス。その変貌は、逃避行のためにエリザベスがブルネットの地毛をブロンドに染めるシーンに象徴されているが、それについてエリザベスを演じるメーガン・ブーンは「金髪になった彼女はぐっと母親に似るようになるの。彼女は自分が謎だと思っていた女性に近づいていくのよ」と指摘する。シーズン3では、そんなエリザベスの変貌とそれを見守るレディントンにも注目だ。

レディントンが現れるまでは、誰から見ても理想的な夫婦だったエリザベスとトム。ところが、トムはレディントンとその敵ベルリンに雇われた潜入工作員だったことが判明。監視する任務で近づいたはずではあったが、エリザベスへの愛情は本物であると主張するトムは、その後もエリザベスを救うため危険をかえりみずに帰国するなど、これまで度々エリザベスの窮地を救ってきた。そんなトムにエリザベスもいつしか心を開き、一時は敵同士だった二人ではあるが、和解して互いへの愛を確かめ合う。やがてトムは、アメリカを捨てて航海の旅に出ようとエリザベスを説得するが、エリザベスは「結社」の陰謀を阻止するため、レディントンと逃避行の旅に出ることに。再び別れを決めた二人ではあるが、エリザベスが無実の罪を着せられて逃亡者の身になっていることを知れば、トムは必ず戻ってくるはず。エリザベスを救うために、彼はどんな行動を起こすのか。見ている者は、逃避行を続けるエリザベスとレディントンの運命だけではなく、エリザベスとトムの関係の行方についてもハラハラさせられるのである。

これまではレディントンと共に行動することはあっても、あくまでFBIに属する捜査官だったエリザベスが、シーズン3では逆にFBIに追われる身になることで、登場人物たちの人間関係も大きな変化を迎える。まず、更迭されたクーパー本部長に代わってエリザベスとレディントンの追跡捜査の陣頭指揮を執ることになったFBI捜査官のレスラーは、自分のパートナーだったエリザベスがロシアのスパイで上院議員を暗殺したとは信じられないながらも、仕事上の責任感ゆえ捜査の手を緩められないジレンマに苦しむ。それに対し、レスラーに同伴してエリザベスとレディントンを追うナヴァービは冷静な視点で任務をまっとうしようとする。イスラエルの諜報機関「モサド」の辣腕エージェントで後からチームに加わったという経緯もあって、ナヴァービがエリザベスとレディントンの二人とは常に一定の距離を保ってきたことが良くわかる一幕である。一方、チームの中で最も温かい人柄の持ち主であるITスペシャリストのアラムは、レスラー以上にエリザベスが背信行為をしたことが信じられず、事あるごとにエリザベスとレディントンを追い詰める捜査に躊躇いを見せる。クーパーに至っては、エリザベスとレディントンの追跡捜査に加わっていないことを逆手に取って、密かに二人を支援する行動に出る。

製作総指揮を手がけるジョン・アイゼンドレイスは、「このドラマは常にレディントンとエリザベスの関係を中心に展開してはいるが、シーズン3では、ストーリーのフォーカスの対象を広げて他のキャラクターたちについてより深く描き込むチャンスが到来する。エリザベスとレディントンの追跡劇を通して、彼らを取り巻く周囲の人間たちのドラマを掘り下げていきたいと考えているんだ」と語っている。シーズン3では、これまでレディントンとエリザベスの陰に隠れて脇役にあまんじてきたキャラクターたちにもスポットライトが当てられ、レスラーやアラム、トム・キーンといった、イケメン脇役キャストのファンにとっては、嬉しいシーズンになりそうだ。

『セックスと嘘とビデオテープ』『セクレタリー』など主演映画も高い評価を受けているジェームズ・スペイダー。これまでに「ザ・プラクティス」「ボストン・リーガル」に主演し、その両方でエミー賞最優秀主演男優賞を受賞している。この他にもさまざまなTVシリーズに出演している彼だが、今回の「ブラックリスト」ではエキセントリックな雰囲気を醸し出して謎に包まれた犯罪者レイモンド・“レッド”・レディントンを体現。自身も製作の最初の段階から関わり、脚本チームとも連絡を密に取り合うなど番組作りに積極的に参加し、“レッド”という謎の男のキャラクターを精巧に作り上げている。レディントンのファッションには欠かせない“帽子”についても、スペイダー自身のアイデアから生まれたものだという。そんなスペイダーがレディントンを演じる上で心がけていることは、可能な限り“ユーモア”を入れ込むことだという。「レッドが自分と同じユーモアのセンスを持っているかどうかはわからないけれどね。」

エリザベスとレディントンがいかにして追っ手をかわしつつ「結社」の悪行を暴いていくかという、より連続ドラマの要素を濃くして、いよいよスリリングな展開を見せる「ブラックリスト　シーズン3」は、エピソードごとに登場する“ブラックリスト”に載った「ブラックリスター（悪役）」も健在。インターネット・メディアをコントロールするハッカー集団、受刑中の辣腕弁護士、農作物テロリスト、顧客の夢想を実現させるという謎の人物などなど、ユニークな悪役が毎回登場して、ドラマをさらに盛り上げている。

そんな“ブラックリスト”の犯罪者を演じる豪華なゲストスターも見どころの一つ。シーズン3では『X-MEN: ファースト・ジェネレーション』のエディ・ガテギが、新キャラクター“ミスター･ソロモン”として登場。『ショート･サーキット』のフィッシャー・スティーヴンスや、前シーズンにも登場したピーウィー・ハーマンとしても知られるコメディアンのポール・ルーベンス、“局長”を演じるデヴィッド･ストラザーンら、個性派俳優が作り上げるインパクト大の“悪役”たちも見逃せない。